A Miskatonic Egyetem Lovecraft fiktív egyeteme, amely az ugyancsak fiktív Arkhamben található. Nevét a Miskatonic-folyóról kapta. Maga az egyetem az 1922-es Herbert West – Reanimatorban jelenik meg először, és az iskola még számos horrortörténet helyszíne lesz. A Dunwich Horrorban az író az egyetemet magas presztízsű, a Harvard színvonalával és népszerűségével vetekedő tanintézményként mutatja be.  

A Miskatonic Egyetemet a már megszűnt Bradford College-ről mintázta Lovecraft. Az intézmény Haverhillben működött, amely malomiparáról volt híres, emellett élesen eltérő társadalmi osztályú lakosai voltak. Lovecraft egyik barátnője járt ebbe az iskolába, és ki volt téve a különböző közösségek ellentéteinek e kísérteties helyen. Lovecraft történeteiben az egyetem hallgatói mind férfi, akárcsak az észak-keleti egyetemek esetében Lovecraft idejében. Az egyetlen diáklány Asenath Waite (A dolog a küszöbön).  

Az egyetem híres az okkult könyvgyűjteményéről. Az egyetemi könyvtárban fellelhető egy valódi példány a Necronomiconból. De ugyancsak megtalálható itt az Unaussprechlichen Kulten Friedrich von Junzttól és a töredékes Eibon könyve.